В 1865 году по инициативе Императорского Русского общества акклиматизации животных и растений в Измайлове, где в середине XVII века находился знаменитый пчельник царя Алексея Михайловича, открылась Измайловская учебно-опытная пасека. В 1867 году на пасеке открылась первая в России пчеловодная выставка. В 1875 году здесь появился музей с уникальной коллекцией ульев.
На пасеке проводили научные опыты и одновременно готовили специалистов высокого класса, здесь работали курсы для пасечников. В октябре 1921 года вышел в свет первый номер нового журнала «Пчеловодное дело», послужившего основой для современного журнала «Пчеловодство». В 1925 году учебно-опытное хозяйство «Измайловская пасека» (за Семёновской заставой) состояло при Московском высшем зоотехническом институте и управлялось Абрамом Титовым.
Посёлок Измайловская Пасека получил своё название 26 августа 1960 года.
В настоящее на историческом месте расположена небольшая пасека, принадлежащая дирекции спецлесхоза «Исторический», где создан эколого-просветительский центр «Царская пасека», названный в честь пчельника Алексея Михайловича. Вокруг «Царской пасеки» организуется сеть эколого-познавательных экскурсионных маршрутов.
